A través de los más de 15 años de trabajo de la Fundación Gaia Amazonas se han involucrado múltiples actores tanto nacionales como internacionales, cuya participación en los diferentes procesos ha hecho posible el avance en la implementación de los derechos indígenas, la conservación de la diversidad bio-cultural y la gobernabilidad local en la Amazonia colombiana. Han sido fundamentales: (i) el compromiso y la continuidad de la cooperación gubernamental internacional proveniente de la Comisión Europea y de algunos países europeos; (ii) el apoyo y la financiación brindadas por ONGs internacionales como The Sigrid Rausing Trust (UK), UICN-Holanda y más recientemente Rainforest Concern (UK) y Blue Moon Fund (USA); (iii) la participación de entidades públicas nacionales, regionales y locales; (iv) las alianzas con ONGs nacionales e internacionales que desarrollan actividades en el Noroeste Amazónico; (v) las relaciones con Organizaciones Indígenas nacionales e internacionales; y (vi) la estrecha relación con las Asociaciones de Autoridades Tradicionales Indígenas.